La AMF cuenta con tres capítulos. El primero agrupa a seis empresas que cuentan con concesiones de transporte ferroviario de carga. El segundo está constituido por los metros y trenes suburbanos de las zonas metropolitanas de las ciudades de México, Monterrey y Guadalajara. El tercero está integrado por proveedores de la industria.
Sus objetivos son:
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Fomentar y proteger la actividad ferroviaria en todo el territorio nacional e impulsar medidas tendientes a su desarrollo.
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Promover la coordinacion con los distintos sectores de la industria para buscar el fortalecimiento del sector ferroviario.
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Representar a sus asociados ante las diversas instancias públicas y privadas con que tenga conexión la actividad ferroviaria para promover el crecimiento y/o resolver controversias.
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Promover y participar en estudios.
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Ser órgano de consulta y colaboración del Estado para el diseño y la ejecución de la política de transporte ferroviario.